虽然赤木律子对何洛的同步率深感失望，何洛自己却发现了新大陆。
在测试过程中，他感觉到有个奇怪的意识试图进入自己的大脑，但是被他拒绝了。
他好奇地问对方，“你这个同步率是如何测试的？我感觉你的设备在读取我的脑电波。”
赤木律子闻言大惊，“你能感觉到脑电波！？是的，没错，同步率确实是包含了脑电波数据，但不止于此。”
“同步率还涉及到你的意识是否与EVA机体契合，以及你的精神状态、战斗意志等方方面面。”
“你的精神状态和战斗意志都没有问题，但就是意识与EVA机体不够契合，这才是最糟糕的地方！”
何洛现在更加确定自己之前的感觉没错，EVA机体并不是死物，而是存在自我意识的生命！
于是他要求道：“能不能让我再测一次？我感觉这一次我能提高同步率！”
赤木律子自然是不信的，“这怎么可能！60%也差太多了，根本没希望！”
但是葛城美里实在是太需要何洛了，于是她抱着死马当活马医的心态，要求赤木律子，“赤木博士，再给他一次机会吧！”
由于NEVR总部在遭到其他乐园玩家的攻击之后损失惨重，主角团队全灭，连NERV的最高军事指挥官碇源堂碇司令也被杀死，因此葛城美里实际上已经是NEVR总部的最高军事主官。
赤木律子拗不过葛城美里，只好让何洛再测试一次。
这一次，何洛戴上检测设备之后，先下手为强，反向入侵了连接在设备另一端的那个意识。
很快的，他就在精神世界里看到了一个白色的巨人——第一使徒亚当！
确切地说，这并不是那位的完整灵魂，而是灵魂投影，因为其意识体高度连第三使徒“水天使”都不如，就算比起何洛也强不了多少。
NEVR在以亚当为原型制造出“零号机”之后，其实就等于是为亚当制作了以分身，不可避免地拥有了祂的灵魂投影。
只不过由于亚当的本体都处于沉睡状态，所以祂的意识投影也表现得浑浑噩噩。
除此之外，何洛又在旁边的一个小岛上看到了另外一个灵魂，赫然是绫波丽的模样。
不过何洛很快就意识到这个意识体并非绫波丽，而是碇真嗣的母亲碇唯！
因为这个意识体身上有种母性的光辉，怀中还抱着一个婴儿模样的精神体，而不是那种未经人事的少女。
那个婴儿形状的精神体，是碇唯对儿子幼时的回忆。
不同于亚当的灵魂投影附着于“零号机”身上，碇唯的灵魂却是位于“初号机”的表层意识小岛上。
经过这番主动出击，何洛已经明白同步率是怎么一回事了。
其实就是EVA驾驶员的灵魂能否与这两位的灵魂产生共鸣，然后在一定程度上激活祂们的战斗能力。
对于拥有灵魂之道的何洛来说，这可就太简单了。
他趁着亚当的灵魂投影浑浑噩噩，便大胆地动起了手脚。
不一会儿工夫，他便在亚当的灵魂投影上面刻画了自己的灵魂烙印，将其据为己有。
至于碇唯的灵魂，何洛出于基本的尊重，没有将其奴役，而是采用从“灵魂宝石”那里学来的灵魂控制能力，对其进行暂时的控制，已达到高同步率。
与此同时，在现实世界里，葛城美里与赤木律子一直在紧张地盯着何洛的同步率数据。
一开始，同步率还是很低，维持在60%。
但是随着时间推移，同步率突然瞬间暴涨到100%。
葛城美里见状大惊，“怎么可能！以前绫波丽和碇真嗣他们三个的同步率都没达到过100%，他是如何做到的？”
赤木律子却发现了一个更加恐怖的地方，“不对！他同时达到了‘零号机’与‘初号机’的100%同步！这是不可能的！”
她们两人虽然不懂灵魂之道，不清楚碇唯的灵魂就寄宿在“初号机”的精神世界里，却非常清楚一件事。
在所有的测试者当中，只有碇唯的克隆体绫波丽与儿子碇真嗣能够与之形成同步，其他人永远都达不到这一点！
可以这么说，“初号机”就是只有碇真嗣与绫波丽才能驾驶的专属机体，其他人都会受到排斥。
而眼前这个来历不明的男人，居然凭借不知道什么手段，轻易地达成了与“初号机”的100%同步率。
赤木律子知道的真相远比葛城美里要更多，所以她的第一反应就是不可能。
相比之下，葛城美里不问原因，只要结果，“太好了！他居然可以驾驶‘零号机’与‘初号机’！赤木博士，麻烦你尽快修好这两台机体！”
赤木律子却摇摇头，“不可能，损坏太严重了！至少需要一个半月以上的时间，才能恢复其主要功能。”
这时候，何洛已经摘下了同步率测试装置，闻言提醒道：“使用‘生命果实’，可以快速修复！”
他也很想试试，驾驶EVA机体进行战斗是什么样的感觉。
要不然总是用肉身对抗体型庞大的使徒，未免也太过于辛苦了。
赤木律子听了何洛的建议，便让人把“生命果实”搬来，将其紧贴在EVA机体的伤口处。
果不其然，“零号机”上的伤口竟然开始快速愈合，残肢断臂也迅速生长。
但是代价同样明显，何洛可以感觉得到，“生命果实”上所蕴含的能量在急剧减少。
赤木律子同样发现了这一点，于是在借助“生命果实”修复好“零号机”之后，说什么也不肯继续用它来修复“初号机”了。
“修一台就足够了，‘若何’君又不能同时驾驶两台！我还要把‘生命果实’和‘四号机’送去分部研究‘S2机关’呢！”
考虑到“S2机关”能够有效改善EVA机体的持续作战能力，确实有尽快研发出来的必要，葛城美里只能同意她的要求。
稍晚一些时候，一架大型运输机从“第三新东京”起飞，载着“四号机”和“生命果实”直奔位于美加大陆的NERV分部，开始了“S2机关”的研发工作。