在九尾之乱后，旗木卡卡西的内心受到了极大的冲击和伤害，他彻底封闭了自己，与外界隔绝。四代火影全家的死亡让他感到无尽的悲痛和愤怒，而无数的孤儿更让他感到无力和绝望。在这种情绪下，他默认了老师的孩子也没有出生，将自己投身在暗部，成为了一个更加冷酷无情的杀手。
团藏看上了卡卡西的才华和实力，并告诉他九尾之乱的事是日斩所为，目的是贪恋权位企图重新当上火影。他希望卡卡西能够在三代火影从火之国领取大名新任命回来的同时刺杀三代火影，并带着根部的木遁忍界甲与卡卡西一起执行这个任务。
卡卡西在听到这个任务后，内心开始动摇。他知道自己已经走上了一条不归路，但是他也明白，如果自己不站出来反抗，那么更多的无辜生命将会受到伤害。于是，他决定接受这个任务，并用自己的方式来完成它。
在执行任务的过程中，卡卡西逐渐发现了团藏的谎言。与团藏相比，日斩的为人更显得正直和可信。这让卡卡西陷入了深深的思考，他开始怀疑自己的选择，也重新审视了团藏的真实面目。
与此同时，卡卡西和甲进行了一次滑稽的刺杀游戏。他们互相试探、攻击，却又在关键时刻相互救助。这场游戏让卡卡西更加明白，甲并非真正的敌人，而是被团藏利用的棋子。
团藏收到卡卡西和甲的消息后，一阵兴奋涌上心头。他以为日斩已经必死无疑，于是迫不及待地坐上了火影的位子，欣赏着窗外的风景，感受着权力的愉悦。
然而，日斩却突然出现，打破了团藏的美梦。日斩微笑着对团藏说：“不好意思，我还不能把这个座位让给其他人。”团藏尴尬地站起身，以为自己这下完蛋了。他无法理解，为何日斩还能活着出现在这里。
然而，出乎团藏意料的是，三代火影并没有对他采取严厉的惩罚。三代火影深深地看了团藏一眼，说道：“我的主义不允许我伤害更多的人。”这让团藏感到十分惊讶，他原本以为自己的刺杀行动会遭到严厉的报复，却没想到三代火影选择了放过他。
团藏起身，对日斩说：“你还是坚持和平主义啊。但你的天真总有一天会毁了你自己。”日斩听后默然不语，但他的信念就是如此，在这个充满变数的时代里，他必须坚定自己的信念才能守护木叶村的和平与安宁。
在一个宁静的夜晚，木叶51年的12月27日。
此时，在忍界的木叶村新上任的三代火影日斩家里，阿修罗的查克拉也在这个特殊的时刻找到了它最合适的宿主——鸣人。这份强大的力量融入了鸣人的脑海深处，与他一同沉睡，等待觉醒的时刻。而在鸣人的脑海中，还有一处神秘的地方，那里封存着穿越者的记忆和思维。这些记忆和思维如同一个方阵，静静地排列在鸣人的意识深处，随着他的成长，将一一解封，揭示出更多的秘密。在博人传这个作为火影忍者世界的平行世界中，九喇嘛，这个在火影忍者正篇中具有极高地位的尾兽，自从鸣人与大筒木一式的战斗之后，就消失了很长时间。在那场激战中，九喇嘛为了保护鸣人，选择了彻底燃烧自己的意识，这使得它的意识一直处于游荡状态，无法进入净土，也无法重生。然而，当这个被改变而造就的平行忍界出现异常时，九喇嘛终于找到了一个机会挤了进来。这个异常可能是由于这个世界中的某些事件或力量导致的九喇嘛并不了解，不过它使得九喇嘛能够重新与这个世界产生联系。九喇嘛的回归无疑给这个世界的鸣人带来了新的变量和可能性。作为一只拥有强大力量的尾兽，九喇嘛的存在将对这个世界的格局和力量平衡产生深远影响。原本散乱在另一个世界的散乱力量，如今在鸣人体内找到了新的归宿。这一刻，躺在封印牢笼中的九尾也似乎感受到了什么，它缓缓地睁开了眼睛。
随着鸣人体内九尾力量的汇聚，所有跟他有关的不管同伴还是敌人都产生了部分变化。此时宇宙外的星河中，无数星光开始浮现。这些星光散发着隐晦的光芒，逐一从宇宙外星河冲向那些曾在剧情中与鸣人有交集和敌对过的人物，不管是忍界星球内的一些选定的人还是在这个平行忍界的大反派大筒木。这些光芒似乎在无声无息中加强着他们的力量和智商，加强程度有强有弱，为未来的战斗埋下了伏笔。
木叶隐村的日向家族迎来了他们的大小姐——日向雏田。她的降生伴随着一种不寻常的现象：月球突然出现了异动。这种异动仿佛是月亮自身在庆祝一个新生命的到来，或者是某种神秘力量在雏田身上觉醒的预兆。一道明亮的月光从月球上射出，穿透厚厚的云层，直射向刚刚降生的雏田。这道月光如此耀眼，以至于在夜晚都能清晰地看到它的轨迹。令所有人惊奇的是，这个刚诞生的婴儿竟然已经觉醒了白眼。白眼是日向家族独特的血继限界，一种强大的瞳术，通常只有在家族成员成长到一定年龄后才能觉醒。而这一切则是辉夜失去神树躯壳后被封印的一部分力量，这一部分降生在刚出生的雏田身上，辉夜的部分力量更是成了雏田身上跟她儿子博人的桃喇嘛一样的存在，那种类似鸣人和九喇嘛但并无封印，类似共生可以交流又无法夺舍的存在。
在宇智波族地，5岁多的宇智波鼬正紧紧抱着他的弟弟佐助在月下哄着。而在他视线抬头看月亮时，突然，佐助体内的因陀罗查克拉的灵魂彻底苏醒，佐助的双眼中闪现出了万花筒写轮眼的光芒，但片刻之后，佐助眼中的万花筒写轮眼却突然消失了，鼬根本没有发现。
在木叶的一个平民区域，一个7个月大的小女婴正在安静地睡觉。突然，一道星光从天而降，温柔地照在了她的身上。在这星光的照耀下，小女婴的脸上逐渐浮现出了不同的表情，仿佛在诉说着她未来的命运。
无数的人都有变化，不过这种变化是潜移默化的，需要一定时间，并未改变他们原有的任何想法。不过在忍界里，对于木叶来说很不幸的是相对来说木叶被星光覆盖的只有很少，毕竟这个世界最初的设定里五大国是平起平坐的，先是忍界的战争与和平全靠木叶，后来更是成了家庭伦理剧，而现在他更正了这个设定，不过好消息是这需要很长的时间。