几天后，平静的日子再次被打破。城市中有人莫名失踪，而且都是在电子设备密集的场所。苏夜怀疑这与之前的幕后黑手有关。
他们四处调查，终于在一个废弃工厂发现线索。工厂内满是奇怪的电子仪器，周围散发着幽冷的蓝光。就在这时，一群机械傀儡冲了出来向他们发动攻击。苏夜等人奋力抵抗，却渐渐处于下风。
突然，苏夜发现这些傀儡的行动似乎受某个信号源控制。顺着信号查找，他们找到了一个隐藏的控制台。苏夜冒险上前破解控制台程序，就在即将成功时，背后传来队友的惊呼声。原来敌人设下陷阱，一道能量屏障困住了他们。
千钧一发之际，苏夜成功改写程序，傀儡停止攻击，屏障也随之消失。同时，他们获取了关于幕后黑手的部分资料。虽然只是冰山一角，但足以让苏夜明白，接下来的战斗更加凶险难测，而他们必须勇往直前。
苏夜仔细查看这份资料，上面显示幕后黑手正在建造一座巨大的电磁塔，一旦建成，整座城市都会被其掌控。他们推测这座电磁塔的位置极有可能在城市中心的地下。于是众人向着城市中心进发。
到达目的地后，他们发现这里看似平常，实则暗门重重。好不容易找到入口进入地下，里面布满各种复杂的线路和大型机械装置。然而刚踏入此地，警报声就响彻四周，紧接着无数新型的机械傀儡涌来。这些傀儡比之前更强大敏捷，还具备自我修复能力。
战斗中，苏夜发现旁边有个主控室模样的房间，也许破坏那里就能停止傀儡攻击。他一边躲避攻击，一边艰难靠近。就在他快要支撑不住时，他冲进主控室，对着里面的核心装置一顿操作。终于，所有傀儡停止运作，而他们也离最终揪出幕后黑手更近一步。
苏夜等人长舒一口气，开始在主控室内寻找线索。在一堆杂乱的数据芯片中，苏夜发现一张加密磁盘。经过一番努力解密，磁盘中的内容令大家惊愕不已。这竟是一份名单，名单上都是城中各界的知名人物，并且标注着他们与幕后黑手的关联程度。
此时，远处传来一阵沉重的脚步声。只见一个身形高大，全身包裹在机甲中的人缓缓走来。“你们以为能阻止我？”机甲人发出低沉的声音。苏夜意识到这便是幕后黑手。双方瞬间剑拔弩张。
苏夜试图与他谈判，希望他放弃邪恶计划。但机甲人却嘲笑他们的天真，并启动了备用防御系统，周围再次涌出大量小型攻击机器人。苏夜和队友们只能再次投入战斗。在激战中，苏夜发现机甲人的能源供应线暴露在外，他瞅准机会，奋力冲向机甲人，斩断了能源供应线。机甲人轰然倒下，这场危机暂时解除。
众人围拢过来，看着倒下的机甲人。苏夜蹲下身子，试图打开机甲外壳找到幕后黑手的真面目。当他费力撬开机甲头部时，却发现里面空无一人。
“怎么回事？难道还有别的操纵者？”队员们面面相觑。
苏夜站起身来环顾四周，突然注意到主控台上有一个闪烁的按钮。他犹豫片刻后按下，面前弹出一道暗门。众人小心翼翼走进暗门后的密室，里面摆满了各种实验器材和培养舱。每个培养舱里都躺着一个昏迷的人，身上插满了管子。
“这是在做人体改造实验？”苏夜震惊道。
就在这时，密室中的大屏幕亮起，画面中出现一个戴着面具的神秘人：“你们以为打败了我的替身就赢了？这一切不过是前奏，真正的灾难即将来临。”话音未落，密室开始剧烈摇晃起来，自毁程序启动了。苏夜大喊一声：“快撤！”带领着队员们朝着出口狂奔而去。
苏夜等人拼尽全力向出口奔去，然而不断有石块从头顶掉落，道路也开始扭曲变形。眼看出口近在咫尺，一个巨大的石块砸落下来，挡住了去路。
“怎么办？”队员们焦急地喊道。苏夜四处张望，看到旁边有一条狭窄的通风管道。“从这里走！”他率先爬进管道。
众人艰难地在管道内爬行，身后的密室爆炸声不绝于耳。终于爬出管道后，外面却是一片陌生的景象。
还没来得及喘口气，一群机械生物朝他们扑来。苏夜握紧武器，“看来真正的战斗才刚开始。”
此时，天空中出现一艘巨型飞船，那个戴面具的神秘人站在船头，大声笑道：“欢迎来到真正的战场！”
苏夜目光坚定，对着队员们喊道：“我们既然走到这儿，就不会退缩。准备迎战吧！”说完便冲向那群机械生物，队员们也纷纷跟上，一场更为惨烈的战斗就此拉开帷幕。
苏夜挥舞着手中的武器，每一次攻击都带着强大的力量，但是机械生物源源不断地涌来。队员们逐渐体力不支，包围圈越缩越小。
就在千钧一发之际，远处传来一阵轰鸣声，只见一群飞行机甲迅速赶来。原来是总部收到消息派来支援的队伍。
苏夜等人精神一振，配合着援军展开反击。在两面夹击下，机械生物渐渐处于下风。
但船上的神秘人却丝毫不慌，他按下一个按钮，那些机械生物突然合体成为一个巨大的机械巨兽。
苏夜心中一惊，这巨兽皮糙肉厚很难对付。他冷静下来观察片刻后发现巨兽关节处较为薄弱。于是他指挥大家集中火力攻击关节部位。
经过一番苦战，巨兽轰然倒地。苏夜乘胜追击，登上飞船要找神秘人算账。当他找到神秘人时，对方摘下面具，竟然是曾经被他们抛弃的队友。他痛恨被抛弃，所以策划了这一系列复仇计划。苏夜刚想说些什么，神秘人却引爆了最后的炸弹，苏夜只能抱着必死的决心冲向炸弹试图阻止爆炸。
就在苏夜快要触碰到炸弹的瞬间，一道奇异的光芒闪过，时间仿佛静止了一般。苏夜惊讶地发现自己身处一个充满科技感的空间内，一个散发着蓝光的球体出现在眼前。
“你是谁？”苏夜警惕地问道。
球体发出声音：“我是来自未来的智能体，此次前来是为了修正这个错误的时间线。你们抛弃队友引发仇恨导致这一切悲剧本不该发生。”
苏夜还没来得及回应，周围场景快速变换，他竟回到了当初决定抛弃队友的那一刻。苏夜大喊：“不行，不能这么做！”众人疑惑地看向他，苏夜解释了未来会发生的事。于是他们重新接纳了那位队友。
场景再度切换，苏夜又回到了飞船上，面前是一脸惊愕的曾经的队友。这时，他真诚地向队友道歉，队友眼中含泪拥抱了苏夜，表示早已释怀。危机解除，苏夜和队员们乘坐飞船返回总部，而这次经历让他们更加珍视彼此间的情谊。