最后两只皮卡丘的十万伏特再加上仙子伊布的魔法闪耀成功解决了这只机器人赶跑了火箭队。
事情最后月桂叶也是原谅了小智，并且还间接学会了泰山压顶的绝招。
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关东地区，大木研究所，大木博士正在整理自己资料室的所有资料，这是他的习惯之一，平常他都是和小建一起做的，可今天小建被他委托有事出去了，没办法了只好他自己独自整理。
让他整理着某一排货架资料时不小心将这个货架上面的一个装着旧资料的箱子给拉了下来。
“我怎么这么不小心？”大木博士一边说着一边将地上散落笔记的资料重新装回箱子里面，就在这时他的手触碰到了一个非常老旧的笔记本。
大木博士一看到那个笔记本顿时呆住了，一瞬间脑海里面有许多模糊的记忆开始交错起来。
“这个笔记本我记得我好像以前用过，但是在哪个时候呢？奇了怪了怎么想不起来了？”以为自己是想多了的大木博士没多想就把那个笔记本又放回去了，之后整理完了资料大木博士就忙着手上还有着其它事赶忙离开了资料室。
只是他不知道的是，在他走了之后，那个箱子里面的那个笔记本一闪过一抹白色与绿色的光芒，在大木脑海里面一个阴暗角处，某个被力量封住的记忆正等待主人的回忆想起。
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大木博士忘记了的回忆：
40年前，还是年轻时的他走在一个森林之中，他要准备去森林里面写生。
就在他准备进入森林深处的唯一隧道里面的时候，一个甜美又清爽的女声传来：“你要进森林吗？”
雪成一抬头就发现一个20多岁的漂亮女生正从隧道上面的墙壁高处攀登跳跃下来，最后落到他的面前。
“如果你听到了森林的声音就不能乱走，这可是村子里面的传说哦。”
“森林的声音是什么意思？”雪成疑惑的问道。
“有的时候森林里面会发出不可思议的声音，那是森林的守护神穿梭时空的时候发出的声音。”
“穿梭时空？”
“没错森林的守护神具有着穿梭时空的力量，所以为了避免被卷入其他的时空，在森林里面听到声音的时候千万不可以走动哦。”
雪成临走的时候那个大姐姐还给了他一块用森林里面的树果做成的面包。
与此同时森林里面，一只绿颜色的形态小巧的神奇宝贝正在被一只黑鲁加和飞天螳螂所追赶，若是白夜在这里的话一定能够认出那只小巧的神奇宝贝就是拥有穿梭时空能力的幻之神奇宝贝雪拉比（时拉比）。
雪拉比四处躲藏，最后一不小心和正在写生的雪成擦肩而过，感觉到不对劲的雪成立马拿起背包追赶上去。
看到雪拉比被飞天螳螂的两只镰刀给缠住的时候雪成奋不顾身冲上前冲开飞天螳螂将雪拉比抱在怀中。
就在这时一个骑着摩托车的中年男人也赶了过来，似乎就是这两只神奇宝贝的训练家。
看到对方似乎想要抢夺雪拉比雪成毫不犹豫的朝着反方向跑去，在奔跑的过程中雪拉比突然发出大声喊叫，一瞬间整个森林都产生了一股能量波动。
“这是……”远处正在劳作的那位大姐姐看到了森林的这股能量波动不知在想什么。
一人一神奇宝贝就这么误打误撞的来到了森林里面小石雕的面前，伴随着雪拉比身上散发出闪亮的绿色光芒联通雪成也被一同吞噬，随后一人一神奇宝贝就消失在了原地，只留下了地上的一个笔记本。
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40年后，某一处小屋内。
已经处于老年时期的那个中年男子被狠狠推到了墙上，在他面前是一个戴着面具的神秘男人和一只狃拉
面具男冷冷地说道：“你在40年前雪拉比逃走的森林的那个位置赶快给我如实招来。”
“他是我的猎物，我不会告诉别人的。”
“哼！真是顽固啊。”随后面具男就拉着那个男人来到了屋子外面，只见外面有着好几个关押神奇宝贝的笼子。
在面具男的示意下，旁边的狃拉跑到关押班吉拉斯的笼子面前用爪子将笼子给割破，而面具男则是淡定的将胸口上的装好的球给取了下来，随后一按按钮使其放大。
“那是……”
“黑暗神奇宝贝球。”
“什么?”
面具男并没有在说话，随即立马扔出手中的神奇宝贝球朝着班吉拉斯扔去，球打在班吉拉斯身上化作一道黑光被收了进去。
“这能让捕捉到的神奇宝贝变得邪恶，使他的力量达到最高的限度。”说完就把班吉拉斯给放了出来，放出来后的班吉拉斯样子跟之前完全不同了，原本胆小的外表变得凶狠，出来后就听从指令到处破坏。
“住手，我告诉你，我告诉你那个森林在哪里。”
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另一边，在城都地区的城镇的小智白夜一行人为了前往下一个城镇准备坐船前往，但是……
白夜看着公示表说道：“真是的这家伙怎么还不来？距离开船的时间已经很近了，之前到底说是去做什么事呢？”
旁边的小刚派出了叉字蝠去看看什么情况。
此时正在对战的小智丝毫没有察觉到时间已经没有了，等到他和皮卡丘打赢了对方之后才看到叉字蝠，这时才知道原来坐船的时间已经快到了。
“要迟到了要迟到了！”最近九牛二虎之力小智和皮卡丘总算是来到了港口，可结果要走过去的时候遇到了一长串运货的车子，等到可以通过的时候轮船都已经开走了。
看到旁边伸长的木梯子小智急中生智立马朝着那里极速奔跑，随后在跑道末段的时候一个飞跃，还好飞船的管理员和小刚以及白夜三人及时把他拉住了，要不然的话他还真会掉到水里面又成了一个落汤鸡。
“小智我说你啊，做事的时候也得顾及一下其他方面啊。”看着差点没有赶上车子的小智白夜没好气的说道。
“抱歉了抱歉了，下次一定改。”
就在这时皮卡丘看到对面河岸边不远处一个华丽的蓝色神奇宝贝似乎在看着他们，赶忙皮卡皮卡的提醒小智他们，下一秒那只神奇宝贝就快速离开了。
“这是……水君？”小智一瞬间就想出了正确答案。